Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CENPJQ9HC77 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CENPJQ9HC77 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CENPJQ9HC77 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CENPJQ9HC77 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CENPJQ9HC77 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CENPJQ9HC77 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CENPJQ9HC77 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CENPJQ9HC77 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CENPJQ9HC77 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CENPJQ9HC77 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CENPJQ9HC77 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CENPJQ9HC77 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CENPJQ9HC77 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CENPJQ9HC77 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CENPJQ9HC77 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CENPJQ9HC77 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CENPJQ9HC77 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CENPJQ9HC77 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CENPJQ9HC77 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CENPJQ9HC77 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CENPJQ9HC77 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CENPJQ9HC77 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CENPJQ9HC77 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CENPJQ9HC77 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CENPJQ9HC77 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CENPJQ9HC77 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CENPJQ9HC77 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CENPJQ9HC77 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CENPJQ9HC77 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CENPJQ9HC77 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CENPJQ9HC77 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CENPJQ9HC77 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CENPJQ9HC77 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CENPJQ9HC77 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CENPJQ9HC77 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CENPJQ9HC77 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CENPJQ9HC77 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CENPJQ9HC77 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CENPJQ9HC77 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CENPJQ9HC77 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CENPJQ9HC77 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CENPJQ9HC77 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CENPJQ9HC77 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CENPJQ9HC77 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CENPJQ9HC77 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CENPJQ9HC77 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CENPJQ9HC77 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CENPJQ9HC77 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CENPJQ9HC77 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CENPJQ9HC77 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CENPJQ9HC77 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CENPJQ9HC77 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CENPJQ9HC77 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CENPJQ9HC77 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CENPJQ9HC77 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CENPJQ9HC77 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CENPJQ9HC77 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CENPJQ9HC77 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CENPJQ9HC77 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CENPJQ9HC77 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CENPJQ9HC77 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CENPJQ9HC77 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CENPJQ9HC77 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CENPJQ9HC77 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CENPJQ9HC77 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CENPJQ9HC77 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CENPJQ9HC77 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CENPJQ9HC77 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CENPJQ9HC77 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CENPJQ9HC77 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CENPJQ9HC77 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CENPJQ9HC77 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CENPJQ9HC77 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CENPJQ9HC77 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CENPJQ9HC77 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CENPJQ9HC77 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CENPJQ9HC77 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CENPJQ9HC77 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CENPJQ9HC77 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CENPJQ9HC77 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CENPJQ9HC77 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CENPJQ9HC77 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CENPJQ9HC77 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CENPJQ9HC77 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CENPJQ9HC77 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CENPJQ9HC77 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CENPJQ9HC77 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CENPJQ9HC77 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CENPJQ9HC77 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CENPJQ9HC77 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CENPJQ9HC77 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CENPJQ9HC77 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CENPJQ9HC77 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CENPJQ9HC77 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CENPJQ9HC77 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CENPJQ9HC77 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CENPJQ9HC77 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CENPJQ9HC77 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CENPJQ9HC77 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms