Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU5

UPF2, Regulator of nonsense transcripts 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF2Q9HAU5 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UPF2Q9HAU5 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UPF2Q9HAU5 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UPF2Q9HAU5 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UPF2Q9HAU5 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UPF2Q9HAU5 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UPF2Q9HAU5 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UPF2Q9HAU5 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UPF2Q9HAU5 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UPF2Q9HAU5 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UPF2Q9HAU5 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UPF2Q9HAU5 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UPF2Q9HAU5 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UPF2Q9HAU5 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UPF2Q9HAU5 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UPF2Q9HAU5 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UPF2Q9HAU5 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UPF2Q9HAU5 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UPF2Q9HAU5 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UPF2Q9HAU5 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UPF2Q9HAU5 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UPF2Q9HAU5 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UPF2Q9HAU5 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UPF2Q9HAU5 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UPF2Q9HAU5 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UPF2Q9HAU5 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UPF2Q9HAU5 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UPF2Q9HAU5 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UPF2Q9HAU5 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UPF2Q9HAU5 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
UPF2Q9HAU5 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UPF2Q9HAU5 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UPF2Q9HAU5 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UPF2Q9HAU5 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UPF2Q9HAU5 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UPF2Q9HAU5 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
UPF2Q9HAU5 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UPF2Q9HAU5 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UPF2Q9HAU5 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UPF2Q9HAU5 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UPF2Q9HAU5 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UPF2Q9HAU5 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UPF2Q9HAU5 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UPF2Q9HAU5 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UPF2Q9HAU5 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UPF2Q9HAU5 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UPF2Q9HAU5 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UPF2Q9HAU5 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UPF2Q9HAU5 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UPF2Q9HAU5 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UPF2Q9HAU5 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UPF2Q9HAU5 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UPF2Q9HAU5 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UPF2Q9HAU5 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
UPF2Q9HAU5 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UPF2Q9HAU5 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UPF2Q9HAU5 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UPF2Q9HAU5 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UPF2Q9HAU5 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UPF2Q9HAU5 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UPF2Q9HAU5 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
UPF2Q9HAU5 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UPF2Q9HAU5 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UPF2Q9HAU5 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UPF2Q9HAU5 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
UPF2Q9HAU5 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UPF2Q9HAU5 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UPF2Q9HAU5 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UPF2Q9HAU5 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UPF2Q9HAU5 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UPF2Q9HAU5 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UPF2Q9HAU5 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UPF2Q9HAU5 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
UPF2Q9HAU5 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UPF2Q9HAU5 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UPF2Q9HAU5 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UPF2Q9HAU5 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UPF2Q9HAU5 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UPF2Q9HAU5 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UPF2Q9HAU5 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UPF2Q9HAU5 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UPF2Q9HAU5 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UPF2Q9HAU5 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UPF2Q9HAU5 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
UPF2Q9HAU5 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
UPF2Q9HAU5 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UPF2Q9HAU5 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UPF2Q9HAU5 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
UPF2Q9HAU5 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UPF2Q9HAU5 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UPF2Q9HAU5 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UPF2Q9HAU5 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UPF2Q9HAU5 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UPF2Q9HAU5 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UPF2Q9HAU5 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UPF2Q9HAU5 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UPF2Q9HAU5 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UPF2Q9HAU5 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UPF2Q9HAU5 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UPF2Q9HAU5 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms