Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0K4

RSPH6A, Radial spoke head protein 6 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH6AQ9H0K4 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RSPH6AQ9H0K4 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RSPH6AQ9H0K4 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RSPH6AQ9H0K4 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RSPH6AQ9H0K4 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RSPH6AQ9H0K4 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RSPH6AQ9H0K4 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RSPH6AQ9H0K4 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RSPH6AQ9H0K4 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RSPH6AQ9H0K4 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RSPH6AQ9H0K4 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RSPH6AQ9H0K4 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RSPH6AQ9H0K4 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RSPH6AQ9H0K4 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RSPH6AQ9H0K4 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RSPH6AQ9H0K4 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RSPH6AQ9H0K4 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RSPH6AQ9H0K4 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RSPH6AQ9H0K4 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RSPH6AQ9H0K4 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RSPH6AQ9H0K4 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RSPH6AQ9H0K4 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RSPH6AQ9H0K4 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RSPH6AQ9H0K4 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RSPH6AQ9H0K4 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RSPH6AQ9H0K4 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RSPH6AQ9H0K4 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RSPH6AQ9H0K4 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RSPH6AQ9H0K4 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RSPH6AQ9H0K4 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RSPH6AQ9H0K4 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RSPH6AQ9H0K4 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RSPH6AQ9H0K4 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RSPH6AQ9H0K4 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RSPH6AQ9H0K4 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RSPH6AQ9H0K4 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RSPH6AQ9H0K4 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RSPH6AQ9H0K4 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RSPH6AQ9H0K4 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RSPH6AQ9H0K4 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RSPH6AQ9H0K4 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RSPH6AQ9H0K4 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RSPH6AQ9H0K4 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RSPH6AQ9H0K4 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RSPH6AQ9H0K4 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RSPH6AQ9H0K4 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RSPH6AQ9H0K4 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RSPH6AQ9H0K4 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RSPH6AQ9H0K4 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RSPH6AQ9H0K4 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RSPH6AQ9H0K4 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RSPH6AQ9H0K4 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RSPH6AQ9H0K4 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RSPH6AQ9H0K4 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RSPH6AQ9H0K4 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RSPH6AQ9H0K4 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RSPH6AQ9H0K4 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RSPH6AQ9H0K4 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RSPH6AQ9H0K4 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RSPH6AQ9H0K4 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RSPH6AQ9H0K4 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RSPH6AQ9H0K4 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RSPH6AQ9H0K4 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RSPH6AQ9H0K4 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RSPH6AQ9H0K4 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RSPH6AQ9H0K4 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RSPH6AQ9H0K4 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RSPH6AQ9H0K4 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RSPH6AQ9H0K4 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RSPH6AQ9H0K4 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RSPH6AQ9H0K4 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RSPH6AQ9H0K4 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RSPH6AQ9H0K4 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RSPH6AQ9H0K4 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RSPH6AQ9H0K4 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RSPH6AQ9H0K4 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RSPH6AQ9H0K4 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RSPH6AQ9H0K4 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RSPH6AQ9H0K4 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RSPH6AQ9H0K4 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RSPH6AQ9H0K4 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RSPH6AQ9H0K4 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RSPH6AQ9H0K4 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RSPH6AQ9H0K4 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RSPH6AQ9H0K4 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RSPH6AQ9H0K4 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RSPH6AQ9H0K4 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RSPH6AQ9H0K4 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RSPH6AQ9H0K4 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RSPH6AQ9H0K4 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RSPH6AQ9H0K4 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RSPH6AQ9H0K4 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RSPH6AQ9H0K4 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RSPH6AQ9H0K4 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RSPH6AQ9H0K4 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RSPH6AQ9H0K4 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RSPH6AQ9H0K4 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RSPH6AQ9H0K4 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RSPH6AQ9H0K4 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RSPH6AQ9H0K4 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms