Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ7

GFRA4, GDNF family receptor alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA4Q9GZZ7 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GFRA4Q9GZZ7 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GFRA4Q9GZZ7 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GFRA4Q9GZZ7 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GFRA4Q9GZZ7 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GFRA4Q9GZZ7 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GFRA4Q9GZZ7 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GFRA4Q9GZZ7 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GFRA4Q9GZZ7 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
GFRA4Q9GZZ7 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GFRA4Q9GZZ7 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
GFRA4Q9GZZ7 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GFRA4Q9GZZ7 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GFRA4Q9GZZ7 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GFRA4Q9GZZ7 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GFRA4Q9GZZ7 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GFRA4Q9GZZ7 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GFRA4Q9GZZ7 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
GFRA4Q9GZZ7 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GFRA4Q9GZZ7 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GFRA4Q9GZZ7 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GFRA4Q9GZZ7 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GFRA4Q9GZZ7 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GFRA4Q9GZZ7 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GFRA4Q9GZZ7 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GFRA4Q9GZZ7 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GFRA4Q9GZZ7 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GFRA4Q9GZZ7 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
GFRA4Q9GZZ7 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GFRA4Q9GZZ7 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GFRA4Q9GZZ7 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GFRA4Q9GZZ7 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GFRA4Q9GZZ7 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GFRA4Q9GZZ7 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
GFRA4Q9GZZ7 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GFRA4Q9GZZ7 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GFRA4Q9GZZ7 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GFRA4Q9GZZ7 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GFRA4Q9GZZ7 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
GFRA4Q9GZZ7 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GFRA4Q9GZZ7 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GFRA4Q9GZZ7 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GFRA4Q9GZZ7 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GFRA4Q9GZZ7 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
GFRA4Q9GZZ7 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
GFRA4Q9GZZ7 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GFRA4Q9GZZ7 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GFRA4Q9GZZ7 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GFRA4Q9GZZ7 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GFRA4Q9GZZ7 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GFRA4Q9GZZ7 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GFRA4Q9GZZ7 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GFRA4Q9GZZ7 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GFRA4Q9GZZ7 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GFRA4Q9GZZ7 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GFRA4Q9GZZ7 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GFRA4Q9GZZ7 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GFRA4Q9GZZ7 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GFRA4Q9GZZ7 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GFRA4Q9GZZ7 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GFRA4Q9GZZ7 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
GFRA4Q9GZZ7 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GFRA4Q9GZZ7 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GFRA4Q9GZZ7 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
GFRA4Q9GZZ7 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
GFRA4Q9GZZ7 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GFRA4Q9GZZ7 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GFRA4Q9GZZ7 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GFRA4Q9GZZ7 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GFRA4Q9GZZ7 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GFRA4Q9GZZ7 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
GFRA4Q9GZZ7 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GFRA4Q9GZZ7 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GFRA4Q9GZZ7 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GFRA4Q9GZZ7 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GFRA4Q9GZZ7 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
GFRA4Q9GZZ7 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GFRA4Q9GZZ7 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
GFRA4Q9GZZ7 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GFRA4Q9GZZ7 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GFRA4Q9GZZ7 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GFRA4Q9GZZ7 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GFRA4Q9GZZ7 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GFRA4Q9GZZ7 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GFRA4Q9GZZ7 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GFRA4Q9GZZ7 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GFRA4Q9GZZ7 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GFRA4Q9GZZ7 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GFRA4Q9GZZ7 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GFRA4Q9GZZ7 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GFRA4Q9GZZ7 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GFRA4Q9GZZ7 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GFRA4Q9GZZ7 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GFRA4Q9GZZ7 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GFRA4Q9GZZ7 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GFRA4Q9GZZ7 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GFRA4Q9GZZ7 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GFRA4Q9GZZ7 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GFRA4Q9GZZ7 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GFRA4Q9GZZ7 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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