Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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