Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUK0

CHCHD7, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD7Q9BUK0 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CHCHD7Q9BUK0 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CHCHD7Q9BUK0 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CHCHD7Q9BUK0 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CHCHD7Q9BUK0 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CHCHD7Q9BUK0 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CHCHD7Q9BUK0 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CHCHD7Q9BUK0 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CHCHD7Q9BUK0 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CHCHD7Q9BUK0 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CHCHD7Q9BUK0 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CHCHD7Q9BUK0 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CHCHD7Q9BUK0 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CHCHD7Q9BUK0 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CHCHD7Q9BUK0 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CHCHD7Q9BUK0 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CHCHD7Q9BUK0 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CHCHD7Q9BUK0 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CHCHD7Q9BUK0 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CHCHD7Q9BUK0 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CHCHD7Q9BUK0 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CHCHD7Q9BUK0 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CHCHD7Q9BUK0 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CHCHD7Q9BUK0 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CHCHD7Q9BUK0 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CHCHD7Q9BUK0 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CHCHD7Q9BUK0 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CHCHD7Q9BUK0 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CHCHD7Q9BUK0 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CHCHD7Q9BUK0 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CHCHD7Q9BUK0 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CHCHD7Q9BUK0 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CHCHD7Q9BUK0 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CHCHD7Q9BUK0 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CHCHD7Q9BUK0 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CHCHD7Q9BUK0 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CHCHD7Q9BUK0 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CHCHD7Q9BUK0 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CHCHD7Q9BUK0 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CHCHD7Q9BUK0 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CHCHD7Q9BUK0 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CHCHD7Q9BUK0 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CHCHD7Q9BUK0 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CHCHD7Q9BUK0 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CHCHD7Q9BUK0 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CHCHD7Q9BUK0 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CHCHD7Q9BUK0 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CHCHD7Q9BUK0 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CHCHD7Q9BUK0 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CHCHD7Q9BUK0 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CHCHD7Q9BUK0 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CHCHD7Q9BUK0 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CHCHD7Q9BUK0 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CHCHD7Q9BUK0 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CHCHD7Q9BUK0 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CHCHD7Q9BUK0 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CHCHD7Q9BUK0 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CHCHD7Q9BUK0 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
CHCHD7Q9BUK0 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CHCHD7Q9BUK0 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CHCHD7Q9BUK0 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CHCHD7Q9BUK0 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CHCHD7Q9BUK0 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CHCHD7Q9BUK0 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CHCHD7Q9BUK0 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CHCHD7Q9BUK0 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CHCHD7Q9BUK0 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CHCHD7Q9BUK0 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
CHCHD7Q9BUK0 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CHCHD7Q9BUK0 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
CHCHD7Q9BUK0 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CHCHD7Q9BUK0 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CHCHD7Q9BUK0 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CHCHD7Q9BUK0 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
CHCHD7Q9BUK0 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CHCHD7Q9BUK0 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CHCHD7Q9BUK0 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CHCHD7Q9BUK0 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CHCHD7Q9BUK0 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CHCHD7Q9BUK0 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CHCHD7Q9BUK0 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CHCHD7Q9BUK0 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CHCHD7Q9BUK0 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CHCHD7Q9BUK0 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CHCHD7Q9BUK0 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CHCHD7Q9BUK0 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CHCHD7Q9BUK0 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CHCHD7Q9BUK0 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CHCHD7Q9BUK0 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CHCHD7Q9BUK0 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CHCHD7Q9BUK0 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CHCHD7Q9BUK0 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CHCHD7Q9BUK0 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CHCHD7Q9BUK0 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CHCHD7Q9BUK0 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CHCHD7Q9BUK0 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CHCHD7Q9BUK0 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CHCHD7Q9BUK0 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CHCHD7Q9BUK0 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CHCHD7Q9BUK0 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms