Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RTKNQ9BST9 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms