Protein–RNA interactions for Protein: Q99607

ELF4, ETS-related transcription factor Elf-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF4Q99607 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ELF4Q99607 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ELF4Q99607 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ELF4Q99607 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ELF4Q99607 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ELF4Q99607 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ELF4Q99607 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ELF4Q99607 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ELF4Q99607 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ELF4Q99607 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ELF4Q99607 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ELF4Q99607 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ELF4Q99607 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ELF4Q99607 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ELF4Q99607 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ELF4Q99607 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms