Protein–RNA interactions for Protein: Q99590

SCAF11, Protein SCAF11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF11Q99590 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCAF11Q99590 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCAF11Q99590 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCAF11Q99590 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCAF11Q99590 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCAF11Q99590 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCAF11Q99590 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SCAF11Q99590 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCAF11Q99590 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCAF11Q99590 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCAF11Q99590 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCAF11Q99590 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCAF11Q99590 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCAF11Q99590 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCAF11Q99590 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCAF11Q99590 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SCAF11Q99590 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCAF11Q99590 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCAF11Q99590 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCAF11Q99590 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCAF11Q99590 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCAF11Q99590 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCAF11Q99590 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCAF11Q99590 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCAF11Q99590 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCAF11Q99590 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCAF11Q99590 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCAF11Q99590 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCAF11Q99590 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SCAF11Q99590 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SCAF11Q99590 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SCAF11Q99590 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SCAF11Q99590 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SCAF11Q99590 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SCAF11Q99590 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SCAF11Q99590 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SCAF11Q99590 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SCAF11Q99590 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SCAF11Q99590 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SCAF11Q99590 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SCAF11Q99590 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SCAF11Q99590 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SCAF11Q99590 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCAF11Q99590 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SCAF11Q99590 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCAF11Q99590 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCAF11Q99590 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCAF11Q99590 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SCAF11Q99590 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCAF11Q99590 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCAF11Q99590 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCAF11Q99590 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCAF11Q99590 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SCAF11Q99590 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCAF11Q99590 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCAF11Q99590 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SCAF11Q99590 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SCAF11Q99590 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCAF11Q99590 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCAF11Q99590 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCAF11Q99590 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCAF11Q99590 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCAF11Q99590 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCAF11Q99590 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCAF11Q99590 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCAF11Q99590 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCAF11Q99590 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCAF11Q99590 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCAF11Q99590 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCAF11Q99590 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCAF11Q99590 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCAF11Q99590 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCAF11Q99590 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCAF11Q99590 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCAF11Q99590 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCAF11Q99590 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SCAF11Q99590 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCAF11Q99590 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SCAF11Q99590 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCAF11Q99590 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCAF11Q99590 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCAF11Q99590 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCAF11Q99590 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCAF11Q99590 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCAF11Q99590 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCAF11Q99590 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCAF11Q99590 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCAF11Q99590 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCAF11Q99590 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCAF11Q99590 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCAF11Q99590 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCAF11Q99590 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCAF11Q99590 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SCAF11Q99590 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCAF11Q99590 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCAF11Q99590 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCAF11Q99590 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCAF11Q99590 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCAF11Q99590 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCAF11Q99590 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms