Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q91

SLC4A9, Anion exchange protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A9Q96Q91 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC4A9Q96Q91 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC4A9Q96Q91 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC4A9Q96Q91 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC4A9Q96Q91 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC4A9Q96Q91 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC4A9Q96Q91 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC4A9Q96Q91 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC4A9Q96Q91 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC4A9Q96Q91 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC4A9Q96Q91 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC4A9Q96Q91 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC4A9Q96Q91 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC4A9Q96Q91 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC4A9Q96Q91 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC4A9Q96Q91 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC4A9Q96Q91 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC4A9Q96Q91 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms