Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLRP3Q96P20 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLRP3Q96P20 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms