Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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C9orf85Q96MD7 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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C9orf85Q96MD7 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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C9orf85Q96MD7 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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C9orf85Q96MD7 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
C9orf85Q96MD7 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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