Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC136Q96JN2 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms