Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH3

MALSU1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1Q96EH3 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms