Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
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GTF3C6Q969F1 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GTF3C6Q969F1 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
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GTF3C6Q969F1 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GTF3C6Q969F1 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GTF3C6Q969F1 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GTF3C6Q969F1 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GTF3C6Q969F1 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GTF3C6Q969F1 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF3C6Q969F1 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF3C6Q969F1 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
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GTF3C6Q969F1 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
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GTF3C6Q969F1 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
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GTF3C6Q969F1 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF3C6Q969F1 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GTF3C6Q969F1 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
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GTF3C6Q969F1 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
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GTF3C6Q969F1 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF3C6Q969F1 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF3C6Q969F1 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF3C6Q969F1 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF3C6Q969F1 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF3C6Q969F1 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF3C6Q969F1 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF3C6Q969F1 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF3C6Q969F1 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF3C6Q969F1 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF3C6Q969F1 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF3C6Q969F1 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF3C6Q969F1 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF3C6Q969F1 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF3C6Q969F1 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF3C6Q969F1 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF3C6Q969F1 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF3C6Q969F1 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF3C6Q969F1 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF3C6Q969F1 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF3C6Q969F1 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF3C6Q969F1 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF3C6Q969F1 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF3C6Q969F1 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF3C6Q969F1 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GTF3C6Q969F1 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
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