Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWI1

LMO7, LIM domain only protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO7Q8WWI1 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMO7Q8WWI1 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMO7Q8WWI1 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMO7Q8WWI1 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMO7Q8WWI1 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMO7Q8WWI1 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMO7Q8WWI1 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMO7Q8WWI1 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMO7Q8WWI1 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMO7Q8WWI1 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
LMO7Q8WWI1 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMO7Q8WWI1 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMO7Q8WWI1 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMO7Q8WWI1 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMO7Q8WWI1 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMO7Q8WWI1 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMO7Q8WWI1 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMO7Q8WWI1 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMO7Q8WWI1 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMO7Q8WWI1 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMO7Q8WWI1 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
LMO7Q8WWI1 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMO7Q8WWI1 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMO7Q8WWI1 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMO7Q8WWI1 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMO7Q8WWI1 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMO7Q8WWI1 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
LMO7Q8WWI1 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms