Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOBEC4Q8WW27 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms