Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATL2Q8NHH9 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATL2Q8NHH9 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATL2Q8NHH9 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATL2Q8NHH9 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ATL2Q8NHH9 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATL2Q8NHH9 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATL2Q8NHH9 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATL2Q8NHH9 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATL2Q8NHH9 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATL2Q8NHH9 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATL2Q8NHH9 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATL2Q8NHH9 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATL2Q8NHH9 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATL2Q8NHH9 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATL2Q8NHH9 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATL2Q8NHH9 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATL2Q8NHH9 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATL2Q8NHH9 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATL2Q8NHH9 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATL2Q8NHH9 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATL2Q8NHH9 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATL2Q8NHH9 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATL2Q8NHH9 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATL2Q8NHH9 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATL2Q8NHH9 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATL2Q8NHH9 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATL2Q8NHH9 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATL2Q8NHH9 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATL2Q8NHH9 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATL2Q8NHH9 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATL2Q8NHH9 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATL2Q8NHH9 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ATL2Q8NHH9 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATL2Q8NHH9 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATL2Q8NHH9 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATL2Q8NHH9 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATL2Q8NHH9 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATL2Q8NHH9 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ATL2Q8NHH9 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATL2Q8NHH9 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATL2Q8NHH9 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATL2Q8NHH9 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATL2Q8NHH9 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATL2Q8NHH9 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATL2Q8NHH9 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATL2Q8NHH9 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATL2Q8NHH9 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATL2Q8NHH9 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATL2Q8NHH9 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATL2Q8NHH9 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATL2Q8NHH9 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATL2Q8NHH9 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATL2Q8NHH9 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATL2Q8NHH9 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATL2Q8NHH9 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATL2Q8NHH9 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATL2Q8NHH9 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATL2Q8NHH9 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATL2Q8NHH9 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATL2Q8NHH9 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATL2Q8NHH9 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATL2Q8NHH9 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ATL2Q8NHH9 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATL2Q8NHH9 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATL2Q8NHH9 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATL2Q8NHH9 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATL2Q8NHH9 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATL2Q8NHH9 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATL2Q8NHH9 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATL2Q8NHH9 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATL2Q8NHH9 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATL2Q8NHH9 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATL2Q8NHH9 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATL2Q8NHH9 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATL2Q8NHH9 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATL2Q8NHH9 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATL2Q8NHH9 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ATL2Q8NHH9 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATL2Q8NHH9 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATL2Q8NHH9 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATL2Q8NHH9 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATL2Q8NHH9 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATL2Q8NHH9 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATL2Q8NHH9 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATL2Q8NHH9 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATL2Q8NHH9 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATL2Q8NHH9 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATL2Q8NHH9 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATL2Q8NHH9 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATL2Q8NHH9 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATL2Q8NHH9 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATL2Q8NHH9 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ATL2Q8NHH9 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATL2Q8NHH9 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATL2Q8NHH9 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATL2Q8NHH9 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATL2Q8NHH9 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATL2Q8NHH9 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATL2Q8NHH9 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms