Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF6

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AVL9Q8NBF6 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
AVL9Q8NBF6 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
AVL9Q8NBF6 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms