Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1G4

LRRC47, Leucine-rich repeat-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC47Q8N1G4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
LRRC47Q8N1G4 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC47Q8N1G4 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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