Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KCNMB4Q86W47 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNMB4Q86W47 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms