Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTX7

CATSPER4, Cation channel sperm-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER4Q7RTX7 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms