Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBR3Q6ZT12 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
UBR3Q6ZT12 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
UBR3Q6ZT12 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
UBR3Q6ZT12 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
UBR3Q6ZT12 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
UBR3Q6ZT12 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBR3Q6ZT12 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBR3Q6ZT12 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBR3Q6ZT12 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBR3Q6ZT12 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBR3Q6ZT12 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBR3Q6ZT12 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBR3Q6ZT12 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBR3Q6ZT12 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBR3Q6ZT12 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBR3Q6ZT12 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBR3Q6ZT12 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBR3Q6ZT12 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBR3Q6ZT12 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBR3Q6ZT12 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBR3Q6ZT12 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBR3Q6ZT12 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBR3Q6ZT12 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBR3Q6ZT12 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBR3Q6ZT12 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBR3Q6ZT12 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBR3Q6ZT12 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBR3Q6ZT12 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBR3Q6ZT12 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBR3Q6ZT12 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBR3Q6ZT12 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBR3Q6ZT12 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBR3Q6ZT12 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBR3Q6ZT12 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBR3Q6ZT12 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBR3Q6ZT12 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
UBR3Q6ZT12 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBR3Q6ZT12 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBR3Q6ZT12 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBR3Q6ZT12 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms