Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC27.51■■■□□ 2
CCDC141Q6ZP82 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
CCDC141Q6ZP82 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC27.51■■■□□ 2
CCDC141Q6ZP82 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC27.51■■■□□ 2
CCDC141Q6ZP82 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
CCDC141Q6ZP82 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CCDC141Q6ZP82 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC141Q6ZP82 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC141Q6ZP82 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC141Q6ZP82 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC141Q6ZP82 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC141Q6ZP82 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC141Q6ZP82 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC141Q6ZP82 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC141Q6ZP82 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC141Q6ZP82 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC141Q6ZP82 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC141Q6ZP82 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC141Q6ZP82 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC141Q6ZP82 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC141Q6ZP82 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC141Q6ZP82 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC141Q6ZP82 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC141Q6ZP82 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC141Q6ZP82 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC141Q6ZP82 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC141Q6ZP82 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC141Q6ZP82 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC141Q6ZP82 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC141Q6ZP82 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC141Q6ZP82 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC141Q6ZP82 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC141Q6ZP82 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC141Q6ZP82 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC141Q6ZP82 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC141Q6ZP82 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC141Q6ZP82 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC141Q6ZP82 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC141Q6ZP82 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC141Q6ZP82 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC141Q6ZP82 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC141Q6ZP82 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC141Q6ZP82 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC141Q6ZP82 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC141Q6ZP82 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC141Q6ZP82 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC141Q6ZP82 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC141Q6ZP82 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC141Q6ZP82 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC141Q6ZP82 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC141Q6ZP82 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC141Q6ZP82 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC141Q6ZP82 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC141Q6ZP82 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC141Q6ZP82 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC141Q6ZP82 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC141Q6ZP82 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC141Q6ZP82 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC141Q6ZP82 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC141Q6ZP82 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC141Q6ZP82 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC141Q6ZP82 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC141Q6ZP82 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC141Q6ZP82 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC141Q6ZP82 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC141Q6ZP82 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC141Q6ZP82 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC141Q6ZP82 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC141Q6ZP82 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC141Q6ZP82 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC141Q6ZP82 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC141Q6ZP82 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC141Q6ZP82 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC141Q6ZP82 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC141Q6ZP82 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC141Q6ZP82 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC141Q6ZP82 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC141Q6ZP82 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC141Q6ZP82 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC141Q6ZP82 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC141Q6ZP82 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC141Q6ZP82 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC141Q6ZP82 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC141Q6ZP82 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC141Q6ZP82 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC141Q6ZP82 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC141Q6ZP82 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC141Q6ZP82 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC141Q6ZP82 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC141Q6ZP82 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC141Q6ZP82 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC141Q6ZP82 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC141Q6ZP82 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC141Q6ZP82 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC141Q6ZP82 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC141Q6ZP82 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC141Q6ZP82 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC141Q6ZP82 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC141Q6ZP82 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC141Q6ZP82 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms