Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms