Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXD1

HRCT1, Histidine-rich carboxyl terminus protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCT1Q6UXD1 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
HRCT1Q6UXD1 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms