Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC174Q6PII3 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms