Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CENPPQ6IPU0 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPPQ6IPU0 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPPQ6IPU0 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPPQ6IPU0 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPPQ6IPU0 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPPQ6IPU0 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPPQ6IPU0 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPPQ6IPU0 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPPQ6IPU0 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPPQ6IPU0 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPPQ6IPU0 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPPQ6IPU0 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPPQ6IPU0 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPPQ6IPU0 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPPQ6IPU0 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPPQ6IPU0 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPPQ6IPU0 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPPQ6IPU0 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPPQ6IPU0 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPPQ6IPU0 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPPQ6IPU0 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPPQ6IPU0 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPPQ6IPU0 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPPQ6IPU0 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPPQ6IPU0 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPPQ6IPU0 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPPQ6IPU0 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPPQ6IPU0 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPPQ6IPU0 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPPQ6IPU0 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPPQ6IPU0 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CENPPQ6IPU0 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CENPPQ6IPU0 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CENPPQ6IPU0 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CENPPQ6IPU0 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CENPPQ6IPU0 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CENPPQ6IPU0 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CENPPQ6IPU0 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CENPPQ6IPU0 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CENPPQ6IPU0 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CENPPQ6IPU0 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CENPPQ6IPU0 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CENPPQ6IPU0 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CENPPQ6IPU0 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CENPPQ6IPU0 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CENPPQ6IPU0 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CENPPQ6IPU0 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CENPPQ6IPU0 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CENPPQ6IPU0 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CENPPQ6IPU0 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CENPPQ6IPU0 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CENPPQ6IPU0 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CENPPQ6IPU0 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CENPPQ6IPU0 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CENPPQ6IPU0 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CENPPQ6IPU0 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CENPPQ6IPU0 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CENPPQ6IPU0 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CENPPQ6IPU0 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CENPPQ6IPU0 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CENPPQ6IPU0 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CENPPQ6IPU0 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CENPPQ6IPU0 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CENPPQ6IPU0 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CENPPQ6IPU0 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CENPPQ6IPU0 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CENPPQ6IPU0 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CENPPQ6IPU0 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CENPPQ6IPU0 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CENPPQ6IPU0 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CENPPQ6IPU0 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CENPPQ6IPU0 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CENPPQ6IPU0 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CENPPQ6IPU0 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CENPPQ6IPU0 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CENPPQ6IPU0 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CENPPQ6IPU0 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CENPPQ6IPU0 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CENPPQ6IPU0 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CENPPQ6IPU0 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CENPPQ6IPU0 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CENPPQ6IPU0 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CENPPQ6IPU0 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CENPPQ6IPU0 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CENPPQ6IPU0 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CENPPQ6IPU0 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CENPPQ6IPU0 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CENPPQ6IPU0 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CENPPQ6IPU0 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CENPPQ6IPU0 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CENPPQ6IPU0 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CENPPQ6IPU0 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CENPPQ6IPU0 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CENPPQ6IPU0 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CENPPQ6IPU0 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CENPPQ6IPU0 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CENPPQ6IPU0 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CENPPQ6IPU0 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CENPPQ6IPU0 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms