Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD40Q6AI12 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms