Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSY0

GKAP1, G kinase-anchoring protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKAP1Q5VSY0 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GKAP1Q5VSY0 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
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