Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV4

BRMS1L, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1LQ5PSV4 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRMS1LQ5PSV4 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRMS1LQ5PSV4 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRMS1LQ5PSV4 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRMS1LQ5PSV4 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRMS1LQ5PSV4 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRMS1LQ5PSV4 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRMS1LQ5PSV4 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRMS1LQ5PSV4 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRMS1LQ5PSV4 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRMS1LQ5PSV4 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRMS1LQ5PSV4 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
BRMS1LQ5PSV4 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRMS1LQ5PSV4 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRMS1LQ5PSV4 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRMS1LQ5PSV4 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRMS1LQ5PSV4 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
BRMS1LQ5PSV4 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
BRMS1LQ5PSV4 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRMS1LQ5PSV4 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRMS1LQ5PSV4 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRMS1LQ5PSV4 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRMS1LQ5PSV4 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRMS1LQ5PSV4 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRMS1LQ5PSV4 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
BRMS1LQ5PSV4 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRMS1LQ5PSV4 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRMS1LQ5PSV4 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRMS1LQ5PSV4 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRMS1LQ5PSV4 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BRMS1LQ5PSV4 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRMS1LQ5PSV4 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRMS1LQ5PSV4 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
BRMS1LQ5PSV4 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRMS1LQ5PSV4 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRMS1LQ5PSV4 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRMS1LQ5PSV4 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRMS1LQ5PSV4 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRMS1LQ5PSV4 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRMS1LQ5PSV4 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRMS1LQ5PSV4 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRMS1LQ5PSV4 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRMS1LQ5PSV4 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRMS1LQ5PSV4 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRMS1LQ5PSV4 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRMS1LQ5PSV4 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRMS1LQ5PSV4 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRMS1LQ5PSV4 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRMS1LQ5PSV4 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRMS1LQ5PSV4 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRMS1LQ5PSV4 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRMS1LQ5PSV4 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRMS1LQ5PSV4 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRMS1LQ5PSV4 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRMS1LQ5PSV4 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRMS1LQ5PSV4 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRMS1LQ5PSV4 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRMS1LQ5PSV4 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
BRMS1LQ5PSV4 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRMS1LQ5PSV4 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRMS1LQ5PSV4 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRMS1LQ5PSV4 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRMS1LQ5PSV4 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRMS1LQ5PSV4 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
BRMS1LQ5PSV4 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRMS1LQ5PSV4 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRMS1LQ5PSV4 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRMS1LQ5PSV4 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRMS1LQ5PSV4 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRMS1LQ5PSV4 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRMS1LQ5PSV4 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRMS1LQ5PSV4 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRMS1LQ5PSV4 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRMS1LQ5PSV4 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRMS1LQ5PSV4 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRMS1LQ5PSV4 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BRMS1LQ5PSV4 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRMS1LQ5PSV4 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRMS1LQ5PSV4 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRMS1LQ5PSV4 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRMS1LQ5PSV4 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRMS1LQ5PSV4 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRMS1LQ5PSV4 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
BRMS1LQ5PSV4 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
BRMS1LQ5PSV4 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRMS1LQ5PSV4 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRMS1LQ5PSV4 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRMS1LQ5PSV4 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRMS1LQ5PSV4 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRMS1LQ5PSV4 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRMS1LQ5PSV4 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRMS1LQ5PSV4 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRMS1LQ5PSV4 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRMS1LQ5PSV4 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRMS1LQ5PSV4 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRMS1LQ5PSV4 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRMS1LQ5PSV4 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRMS1LQ5PSV4 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRMS1LQ5PSV4 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRMS1LQ5PSV4 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms