Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
ANKRD39Q53RE8 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms