Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RFTN2Q52LD8 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms