Protein–RNA interactions for Protein: Q4VC31

CCDC58, Coiled-coil domain-containing protein 58, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC58Q4VC31 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC58Q4VC31 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC58Q4VC31 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC58Q4VC31 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC58Q4VC31 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC58Q4VC31 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC58Q4VC31 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC58Q4VC31 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC58Q4VC31 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC58Q4VC31 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC58Q4VC31 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC58Q4VC31 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC58Q4VC31 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC58Q4VC31 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC58Q4VC31 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC58Q4VC31 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC58Q4VC31 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC58Q4VC31 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC58Q4VC31 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC58Q4VC31 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC58Q4VC31 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC58Q4VC31 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC58Q4VC31 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC58Q4VC31 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC58Q4VC31 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC58Q4VC31 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC58Q4VC31 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC58Q4VC31 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC58Q4VC31 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC58Q4VC31 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC58Q4VC31 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC58Q4VC31 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC58Q4VC31 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC58Q4VC31 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC58Q4VC31 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC58Q4VC31 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC58Q4VC31 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC58Q4VC31 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC58Q4VC31 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC58Q4VC31 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC58Q4VC31 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC58Q4VC31 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC58Q4VC31 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC58Q4VC31 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC58Q4VC31 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC58Q4VC31 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC58Q4VC31 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC58Q4VC31 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC58Q4VC31 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC58Q4VC31 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC58Q4VC31 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC58Q4VC31 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC58Q4VC31 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC58Q4VC31 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC58Q4VC31 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC58Q4VC31 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC58Q4VC31 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC58Q4VC31 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC58Q4VC31 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC58Q4VC31 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC58Q4VC31 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC58Q4VC31 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC58Q4VC31 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC58Q4VC31 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC58Q4VC31 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC58Q4VC31 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC58Q4VC31 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC58Q4VC31 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC58Q4VC31 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC58Q4VC31 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC58Q4VC31 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC58Q4VC31 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC58Q4VC31 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC58Q4VC31 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC58Q4VC31 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC58Q4VC31 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC58Q4VC31 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC58Q4VC31 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC58Q4VC31 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC58Q4VC31 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC58Q4VC31 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC58Q4VC31 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC58Q4VC31 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC58Q4VC31 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC58Q4VC31 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC58Q4VC31 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC58Q4VC31 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC58Q4VC31 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC58Q4VC31 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC58Q4VC31 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC58Q4VC31 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC58Q4VC31 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC58Q4VC31 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC58Q4VC31 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC58Q4VC31 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC58Q4VC31 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC58Q4VC31 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC58Q4VC31 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC58Q4VC31 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC58Q4VC31 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms