Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC153Q494R4 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms