Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC27Q2M243 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC27Q2M243 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC27Q2M243 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC27Q2M243 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC27Q2M243 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC27Q2M243 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC27Q2M243 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC27Q2M243 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC27Q2M243 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC27Q2M243 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC27Q2M243 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC27Q2M243 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC27Q2M243 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC27Q2M243 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC27Q2M243 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC27Q2M243 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC27Q2M243 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC27Q2M243 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC27Q2M243 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC27Q2M243 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC27Q2M243 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC27Q2M243 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC27Q2M243 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC27Q2M243 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC27Q2M243 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC27Q2M243 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC27Q2M243 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC27Q2M243 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC27Q2M243 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC27Q2M243 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC27Q2M243 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC27Q2M243 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC27Q2M243 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC27Q2M243 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC27Q2M243 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC27Q2M243 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC27Q2M243 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC27Q2M243 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC27Q2M243 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC27Q2M243 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms