Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLPPQ16740 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
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