Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTF1Q16619 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms