Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACKR1Q16570 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACKR1Q16570 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ACKR1Q16570 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACKR1Q16570 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACKR1Q16570 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACKR1Q16570 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACKR1Q16570 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACKR1Q16570 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACKR1Q16570 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACKR1Q16570 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACKR1Q16570 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACKR1Q16570 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACKR1Q16570 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACKR1Q16570 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACKR1Q16570 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACKR1Q16570 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ACKR1Q16570 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACKR1Q16570 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACKR1Q16570 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACKR1Q16570 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACKR1Q16570 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACKR1Q16570 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACKR1Q16570 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACKR1Q16570 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACKR1Q16570 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACKR1Q16570 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACKR1Q16570 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACKR1Q16570 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACKR1Q16570 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACKR1Q16570 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACKR1Q16570 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ACKR1Q16570 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACKR1Q16570 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACKR1Q16570 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACKR1Q16570 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACKR1Q16570 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACKR1Q16570 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACKR1Q16570 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ACKR1Q16570 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACKR1Q16570 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACKR1Q16570 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACKR1Q16570 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACKR1Q16570 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACKR1Q16570 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ACKR1Q16570 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACKR1Q16570 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACKR1Q16570 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ACKR1Q16570 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ACKR1Q16570 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ACKR1Q16570 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACKR1Q16570 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACKR1Q16570 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACKR1Q16570 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACKR1Q16570 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACKR1Q16570 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACKR1Q16570 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACKR1Q16570 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACKR1Q16570 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACKR1Q16570 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACKR1Q16570 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACKR1Q16570 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACKR1Q16570 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ACKR1Q16570 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACKR1Q16570 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACKR1Q16570 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACKR1Q16570 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACKR1Q16570 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACKR1Q16570 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACKR1Q16570 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACKR1Q16570 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACKR1Q16570 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACKR1Q16570 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACKR1Q16570 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACKR1Q16570 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACKR1Q16570 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACKR1Q16570 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACKR1Q16570 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACKR1Q16570 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACKR1Q16570 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACKR1Q16570 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACKR1Q16570 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACKR1Q16570 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACKR1Q16570 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACKR1Q16570 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACKR1Q16570 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACKR1Q16570 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ACKR1Q16570 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACKR1Q16570 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACKR1Q16570 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACKR1Q16570 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACKR1Q16570 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACKR1Q16570 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACKR1Q16570 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ACKR1Q16570 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACKR1Q16570 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACKR1Q16570 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACKR1Q16570 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACKR1Q16570 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACKR1Q16570 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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