Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
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SSX1Q16384 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSX1Q16384 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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