Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
E2F4Q16254 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
E2F4Q16254 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
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