Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

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Length 529 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHRNA2Q15822 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
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