Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF1AQ15573 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF1AQ15573 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
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