Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRF4Q15306 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRF4Q15306 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRF4Q15306 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRF4Q15306 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
IRF4Q15306 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRF4Q15306 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRF4Q15306 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
IRF4Q15306 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRF4Q15306 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRF4Q15306 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRF4Q15306 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
IRF4Q15306 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRF4Q15306 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRF4Q15306 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRF4Q15306 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRF4Q15306 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRF4Q15306 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRF4Q15306 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRF4Q15306 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRF4Q15306 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRF4Q15306 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IRF4Q15306 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRF4Q15306 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRF4Q15306 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRF4Q15306 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRF4Q15306 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRF4Q15306 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRF4Q15306 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRF4Q15306 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRF4Q15306 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRF4Q15306 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRF4Q15306 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRF4Q15306 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRF4Q15306 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRF4Q15306 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRF4Q15306 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
IRF4Q15306 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRF4Q15306 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRF4Q15306 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRF4Q15306 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
IRF4Q15306 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRF4Q15306 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
IRF4Q15306 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRF4Q15306 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRF4Q15306 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IRF4Q15306 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRF4Q15306 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRF4Q15306 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRF4Q15306 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRF4Q15306 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRF4Q15306 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRF4Q15306 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRF4Q15306 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRF4Q15306 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRF4Q15306 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRF4Q15306 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRF4Q15306 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRF4Q15306 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRF4Q15306 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRF4Q15306 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRF4Q15306 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRF4Q15306 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRF4Q15306 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRF4Q15306 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IRF4Q15306 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRF4Q15306 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRF4Q15306 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRF4Q15306 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRF4Q15306 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRF4Q15306 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRF4Q15306 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRF4Q15306 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRF4Q15306 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRF4Q15306 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRF4Q15306 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRF4Q15306 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRF4Q15306 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRF4Q15306 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRF4Q15306 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRF4Q15306 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRF4Q15306 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRF4Q15306 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRF4Q15306 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRF4Q15306 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRF4Q15306 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRF4Q15306 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRF4Q15306 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
IRF4Q15306 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRF4Q15306 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRF4Q15306 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRF4Q15306 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRF4Q15306 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRF4Q15306 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IRF4Q15306 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IRF4Q15306 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IRF4Q15306 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IRF4Q15306 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IRF4Q15306 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
IRF4Q15306 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms