Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRKD1Q15139 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms