Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
R3HDM1Q15032 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
R3HDM1Q15032 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
R3HDM1Q15032 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
R3HDM1Q15032 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
R3HDM1Q15032 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
R3HDM1Q15032 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
R3HDM1Q15032 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
R3HDM1Q15032 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
R3HDM1Q15032 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
R3HDM1Q15032 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
R3HDM1Q15032 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
R3HDM1Q15032 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
R3HDM1Q15032 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
R3HDM1Q15032 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
R3HDM1Q15032 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
R3HDM1Q15032 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
R3HDM1Q15032 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
R3HDM1Q15032 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
R3HDM1Q15032 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
R3HDM1Q15032 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
R3HDM1Q15032 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
R3HDM1Q15032 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
R3HDM1Q15032 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
R3HDM1Q15032 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
R3HDM1Q15032 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
R3HDM1Q15032 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
R3HDM1Q15032 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
R3HDM1Q15032 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
R3HDM1Q15032 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
R3HDM1Q15032 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
R3HDM1Q15032 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
R3HDM1Q15032 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
R3HDM1Q15032 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
R3HDM1Q15032 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
R3HDM1Q15032 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
R3HDM1Q15032 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
R3HDM1Q15032 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
R3HDM1Q15032 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
R3HDM1Q15032 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
R3HDM1Q15032 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
R3HDM1Q15032 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
R3HDM1Q15032 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
R3HDM1Q15032 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
R3HDM1Q15032 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
R3HDM1Q15032 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
R3HDM1Q15032 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
R3HDM1Q15032 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
R3HDM1Q15032 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
R3HDM1Q15032 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
R3HDM1Q15032 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
R3HDM1Q15032 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
R3HDM1Q15032 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
R3HDM1Q15032 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
R3HDM1Q15032 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
R3HDM1Q15032 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
R3HDM1Q15032 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
R3HDM1Q15032 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
R3HDM1Q15032 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
R3HDM1Q15032 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
R3HDM1Q15032 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
R3HDM1Q15032 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
R3HDM1Q15032 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
R3HDM1Q15032 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
R3HDM1Q15032 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
R3HDM1Q15032 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
R3HDM1Q15032 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
R3HDM1Q15032 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
R3HDM1Q15032 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
R3HDM1Q15032 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
R3HDM1Q15032 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
R3HDM1Q15032 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
R3HDM1Q15032 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
R3HDM1Q15032 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
R3HDM1Q15032 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
R3HDM1Q15032 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
R3HDM1Q15032 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
R3HDM1Q15032 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
R3HDM1Q15032 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
R3HDM1Q15032 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
R3HDM1Q15032 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
R3HDM1Q15032 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
R3HDM1Q15032 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
R3HDM1Q15032 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
R3HDM1Q15032 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
R3HDM1Q15032 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
R3HDM1Q15032 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
R3HDM1Q15032 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
R3HDM1Q15032 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
R3HDM1Q15032 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
R3HDM1Q15032 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
R3HDM1Q15032 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
R3HDM1Q15032 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
R3HDM1Q15032 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
R3HDM1Q15032 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
R3HDM1Q15032 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
R3HDM1Q15032 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
R3HDM1Q15032 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
R3HDM1Q15032 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
R3HDM1Q15032 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
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