Protein–RNA interactions for Protein: Q15021

NCAPD2, Condensin complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPD2Q15021 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NCAPD2Q15021 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NCAPD2Q15021 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NCAPD2Q15021 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NCAPD2Q15021 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NCAPD2Q15021 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NCAPD2Q15021 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
NCAPD2Q15021 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NCAPD2Q15021 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
NCAPD2Q15021 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NCAPD2Q15021 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NCAPD2Q15021 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCAPD2Q15021 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCAPD2Q15021 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCAPD2Q15021 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCAPD2Q15021 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCAPD2Q15021 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCAPD2Q15021 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCAPD2Q15021 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCAPD2Q15021 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCAPD2Q15021 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NCAPD2Q15021 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCAPD2Q15021 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCAPD2Q15021 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NCAPD2Q15021 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCAPD2Q15021 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCAPD2Q15021 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCAPD2Q15021 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCAPD2Q15021 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NCAPD2Q15021 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms