Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GBX1Q14549 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GBX1Q14549 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GBX1Q14549 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GBX1Q14549 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GBX1Q14549 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GBX1Q14549 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GBX1Q14549 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GBX1Q14549 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GBX1Q14549 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GBX1Q14549 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GBX1Q14549 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GBX1Q14549 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GBX1Q14549 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GBX1Q14549 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GBX1Q14549 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GBX1Q14549 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GBX1Q14549 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GBX1Q14549 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GBX1Q14549 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GBX1Q14549 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GBX1Q14549 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GBX1Q14549 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GBX1Q14549 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GBX1Q14549 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GBX1Q14549 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GBX1Q14549 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GBX1Q14549 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GBX1Q14549 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GBX1Q14549 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
GBX1Q14549 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GBX1Q14549 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GBX1Q14549 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GBX1Q14549 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
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GBX1Q14549 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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GBX1Q14549 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GBX1Q14549 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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