Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTTNQ14247 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms