Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
COL4A6Q14031 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
COL4A6Q14031 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
COL4A6Q14031 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
COL4A6Q14031 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
COL4A6Q14031 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
COL4A6Q14031 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
COL4A6Q14031 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
COL4A6Q14031 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
COL4A6Q14031 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
COL4A6Q14031 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
COL4A6Q14031 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
COL4A6Q14031 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
COL4A6Q14031 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
COL4A6Q14031 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
COL4A6Q14031 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
COL4A6Q14031 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
COL4A6Q14031 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
COL4A6Q14031 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
COL4A6Q14031 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
COL4A6Q14031 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
COL4A6Q14031 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
COL4A6Q14031 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
COL4A6Q14031 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
COL4A6Q14031 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
COL4A6Q14031 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
COL4A6Q14031 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
COL4A6Q14031 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
COL4A6Q14031 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
COL4A6Q14031 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
COL4A6Q14031 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
COL4A6Q14031 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
COL4A6Q14031 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
COL4A6Q14031 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
COL4A6Q14031 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
COL4A6Q14031 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
COL4A6Q14031 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
COL4A6Q14031 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
COL4A6Q14031 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
COL4A6Q14031 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
COL4A6Q14031 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
COL4A6Q14031 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
COL4A6Q14031 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
COL4A6Q14031 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
COL4A6Q14031 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
COL4A6Q14031 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
COL4A6Q14031 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
COL4A6Q14031 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
COL4A6Q14031 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
COL4A6Q14031 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
COL4A6Q14031 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
COL4A6Q14031 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
COL4A6Q14031 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
COL4A6Q14031 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
COL4A6Q14031 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
COL4A6Q14031 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
COL4A6Q14031 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
COL4A6Q14031 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
COL4A6Q14031 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
COL4A6Q14031 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
COL4A6Q14031 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
COL4A6Q14031 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
COL4A6Q14031 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
COL4A6Q14031 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
COL4A6Q14031 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
COL4A6Q14031 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
COL4A6Q14031 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
COL4A6Q14031 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
COL4A6Q14031 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
COL4A6Q14031 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
COL4A6Q14031 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
COL4A6Q14031 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COL4A6Q14031 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COL4A6Q14031 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
COL4A6Q14031 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
COL4A6Q14031 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
COL4A6Q14031 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
COL4A6Q14031 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
COL4A6Q14031 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
COL4A6Q14031 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COL4A6Q14031 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COL4A6Q14031 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
COL4A6Q14031 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
COL4A6Q14031 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
COL4A6Q14031 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
COL4A6Q14031 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
COL4A6Q14031 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
COL4A6Q14031 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COL4A6Q14031 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COL4A6Q14031 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COL4A6Q14031 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
COL4A6Q14031 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COL4A6Q14031 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
COL4A6Q14031 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
COL4A6Q14031 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
COL4A6Q14031 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COL4A6Q14031 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COL4A6Q14031 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COL4A6Q14031 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COL4A6Q14031 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
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